STAR – це елайнер, призначений для спеціально для вирішення багатьох проблем
відображення даних за допомогою стратегії для врахування зрощених вирівнювань.
Ми будемо використовувати STAR Aligner (STAR), який є універсальним елайнером для картування послідовностей проти великого еталонного геному. Процес вирівнювання складається з двох етапів: Індексування еталонного геному. Вирівнювання зчитувань із еталонним геномом.
Вирівнювачі чистих зубів – це ортодонтичні пристрої, які використовуються для переставити і вирівняти зуби, з мінімальним впливом на повсякденне життя користувача. Це пов’язано з тим, що пристрій, схожий на фіксатор, розроблено таким чином, що його можна знімати та майже непомітний під час використання.
~27 ГБ високої швидкості відображення STAR компенсується використанням оперативної пам’яті: STAR вимагає ∼27 Гб оперативної пам'яті для узгодження з геномом людини. Як і всі інші вирівнювачі, за винятком RUM, обсяг оперативної пам’яті, який використовує STAR, не збільшується суттєво зі збільшенням кількості потоків, оскільки SA ділиться між усіма потоками.
ЗІРКА вирівнює зчитування, знаходячи збіги максимального відображуваного префікса (MMP) між зчитуваннями (або парами зчитувань) і геномом, використовуючи індекс суфіксального масиву. Різні частини зчитування можуть бути зіставлені з різними положеннями генома, що відповідає сплайсингу або злиттям РНК.
STAR використовує підхід прямого підрахунку на відміну від Kallisto, який використовує оцінку і через такий спосіб підрахунку STAR завжди буде точнішим за Kallisto. 2. Може кількісно визначити рівні експресії генів на основі підрахунку читань. 3.