Крім нозерн-блот-тестів і SAGE-аналізів, існує кілька інших методів аналізу експресії генів. Більшість цих методик, в т.ч аналіз мікроматриць і полімеразна ланцюгова реакція зворотної транскрипції (RT-PCR), працюють шляхом вимірювання рівнів мРНК.

Кількісне визначення експресії генів цифрова ПЛР Цифрова ПЛР дозволяє проводити високоточні вимірювання та здатна виявляти зміни рівня експресії генів у два або менше разів. Цифрова ПЛР також може бути використана для визначення абсолютної кількісної оцінки транскрипту без необхідності використання еталонного гена.

Для визначення експресії генів використовуються різні методики. До них відносяться Мікрочипи ДНК і технології секвенування. Перший вимірює активність конкретних генів, що представляють інтерес, а другий дозволяє дослідникам визначити всі активні гени в клітині [5].

Визначення моделі та часу експресії генів можна здійснити за допомогою заміна кодуючої частини досліджуваного гена репортерним геном. У більшості випадків експресія репортерного гена потім контролюється шляхом відстеження флуоресценції або ферментативної активності його білкового продукту (стор. 518–519).

Експресія генів — це процес, за допомогою якого інформація, закодована в гені, перетворюється на функцію. Здебільшого це відбувається через транскрипція молекул РНК, які кодують білки, або некодуючих молекул РНК, які виконують інші функції.

Зворотна транскрипція РНК до кДНК і ампліфікація кДНК-мішеней за допомогою ПЛР вважається золотим стандартом техніки експресії генів для виявлення різних транскриптів РНК і експериментів з експресією, а також доступний для профілювання мікроРНК [85,131].